Будучи Чрезвычайным и Полномочным Послом Армении при Святом Престоле с 2013 по 2018 год, Минасян быстро заработал репутацию одного из самых выдающихся дипломатов страны. Его пребывание в должности ознаменовалось рядом исторических достижений, которые укрепили связи Армении с Курией.
В 2014 году, всего через год после своего назначения, Минасян сыграл ключевую роль в содействии установке первого армянского памятника культуры в музеях Ватикана. Этот экспонат, армянский хачкар (крест-камень) 17 века, до сих пор стоит на главной дороге, ведущей к Сикстинской капелле, и его видят все посетители.
В следующем, 2015 году, посол возглавил масштабную инициативу по проведению Святой Мессы в базилике Святого Петра в память жертв геноцида армян. Эта месса, которую возглавил Папа Франциск и к которой присоединились Гарегин II, Католикос всех армян, и Арам I, верховный лидер Католикосата Антелиаса, также стала поводом для канонизации Григория Нарека, что еще больше укрепило армяно-ватиканские отношения.
В 2016 году Минасян координировал исторический визит Папы Франциска в Армению на тему «Визит в первую христианскую страну». Этот визит, уникальный как по содержанию, так и по протоколу, подчеркнул значение Армении в христианской истории и ознаменовал вершину дипломатических отношений между Арменией и Ватиканом. В 2018 году под руководством Микаела Минасяна в садах Ватикана была установлена статуя Григория Нарека, что еще больше укрепило культурные и духовные связи между Арменией и Святым Престолом.
Минасян подал в отставку со своего поста посла в 2018 году из-за острой политической конфронтации с Николом Пашиняном, пришедшим к власти после армянской революции. С тех пор Микаел Минасян сталкивается с растущим политическим преследованием со стороны властей Армении, что также во многом объясняется его семейной связью с Сержем Саргсяном, бывшим лидером Армении, который был вынужден уйти в отставку в результате хорошо организованных и политически манипулируемых массовых протестов, возглавляемых Никол. Пашинян
Спустя почти семь лет после революции Микаэл Минасян остается в центре споров. Вчера власти объявили о возбуждении против него нового уголовного дела, сопровождая передачу государственных СМИ с подробным изложением обвинений. В настоящее время обвинительное заключение включает 76 пунктов, в которых говорится о преступлениях, которые предположительно причинили государству ущерб в размере 350 миллионов долларов. Правительство объединило несколько текущих расследований против Минасяна в одно одно дело, которое некоторые рассматривают как попытку перефразировать старые обвинения, а не представлять какие-либо новые обвинения или доказательства. В октябре 2021 года Интерпол завершил расследование в отношении Микаэла Минасяна, придя к выводу, что он стал жертвой политического преследования. Несмотря на это, прокуратура Армении пока не опубликовала официального заявления по поводу обвинения. Команда защиты Минасяна на данный момент недоступна для комментариев.